Po pokonaniu Bowsera i uratowaniu Brooklynu Mario staje przed nowym zagrożeniem: złowrogim sojuszem Wario i Bowsera Jr. Teraz, wraz z przyjaciółmi i Yoshim u boku, musi powstrzymać ich plany podboju świata.W drugiej części filmu zobaczymy wszystko co sprawdziło się w pierwszej, czyli przygodę, humor, masę postaci i spektakularną wizualnie animację. Dodatkowo pojawią się niespodzianki dla fanów każdej ery Mario. Niektóre wątki fabularne zostały już ujawnione, w tym Yoshi, ukochany zielony dinozaur i ikoniczna postać z serii, inne wciąż pozostają tajemnicą. Pewne jest natomiast, że będzie to film, który spodoba się zarówno długoletnim fanom Super Mario, jak i nowym widzom, którzy jeszcze nie poznali Mario i świata Nintendo.